More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5289 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  100 
 
 		 318 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  51.94 
 
 		 307 aa  275  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  48.28 
 
 		 324 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.66 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  47.62 
 
 		 293 aa  242  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  56.77 
 
 		 291 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  44.78 
 
 		 303 aa  232  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  51.48 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  51.48 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.57 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  48.31 
 
 		 288 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  50.18 
 
 		 299 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  53.57 
 
 		 310 aa  218  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.07 
 
 		 287 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  47.43 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  47.27 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  45.86 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.88 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  48.92 
 
 		 291 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  50.18 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.32 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.77 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.34 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.03 
 
 		 317 aa  188  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  43.59 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  39.2 
 
 		 335 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.84 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  51.72 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.36 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.4 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.54 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  34.59 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.61 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  35.98 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  32.98 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  35.61 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  35.23 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 		 293 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  34.75 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  34.75 
 
 		 284 aa  92.4  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  34.36 
 
 		 284 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  34.36 
 
 		 284 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  29.43 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  28.77 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  27.63 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  29.91 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  29.91 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  27.82 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  28.5 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  30.08 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  29.03 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  31.33 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  31.22 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  31.33 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  31.88 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  28.46 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  28.46 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  27.8 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  30.04 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  29.13 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  28.09 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  28.09 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  28.09 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  28.09 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  29.22 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  30.67 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  28.35 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  28.14 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  29.83 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  28.24 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  28.44 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.97 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  29.79 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  30.77 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  25.09 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  30.61 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  31.43 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  32.51 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  30.49 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  28.21 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  29.49 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.36 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  32.31 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  28.9 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  29.04 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  31.79 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  27.24 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  29.82 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  28 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  28.38 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  28 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>