More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4210 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 290 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  88.58 
 
 		 291 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  81 
 
 		 299 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  75.52 
 
 		 290 aa  411  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  74.83 
 
 		 290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  48.94 
 
 		 294 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  48.94 
 
 		 294 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  49.82 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  54.36 
 
 		 395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  43.66 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  45 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  45.52 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  46.76 
 
 		 307 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.55 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  45.25 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  51.15 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  48.75 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  43.43 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.33 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.73 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  39.33 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.04 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  44.32 
 
 		 346 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  44.31 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  38.67 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.15 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  46.95 
 
 		 309 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.38 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.97 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  33.72 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  33.72 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  33.72 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.56 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.18 
 
 		 362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  35.04 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  35.04 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  35.04 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  35.08 
 
 		 284 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  29.81 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  27.76 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  28.11 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  31.09 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  29.69 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  32.22 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  29.35 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  29.23 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  27.99 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  29.07 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  30.03 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  27.08 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.38 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  30.15 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  31.29 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  29 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  29.9 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  27.53 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  29.01 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  27.65 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  28.37 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  28.48 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  28.68 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  28.68 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  28.68 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  28.27 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  28.91 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.08 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  28.9 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  26.76 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  28.99 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13801  SMR family transporter PecM  26.28 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  29.49 
 
 		 356 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.82 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  27.8 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.04 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  22.81 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  29.9 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  27.82 
 
 		 400 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  27.82 
 
 		 400 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>