More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1858 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  586  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4446  hypothetical protein  48.43 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3207  hypothetical protein  47.89 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4953  hypothetical protein  47.54 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.17 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  33.56 
 
 		 379 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.99 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  26.14 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  26.69 
 
 		 304 aa  99  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.18 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  32.51 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  33.57 
 
 		 364 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  32.75 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.91 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  30.18 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.2 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  32.06 
 
 		 334 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  29.24 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  32.51 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  30.34 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  29.03 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.96 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  31.52 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  29.58 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0388  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 		 289 aa  85.5  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  25.72 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  29 
 
 		 311 aa  85.5  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  29.51 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  29.63 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  32.62 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  28.52 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  30.88 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  29.04 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  30.56 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  30.56 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  30.53 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  29.43 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  29.43 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  28.71 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  28.71 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  25.72 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  29.43 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.45 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  31.77 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.85 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  32.08 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  25.61 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  32.48 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  29.33 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  29.1 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  29.1 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  29.1 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  28.95 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  33.45 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  32.56 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  26.64 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  28.42 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  28.72 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  25.89 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  28 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  26.67 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  28.32 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  28.32 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0070  hypothetical protein  28.32 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.623424  hitchhiker  0.00000000180064 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.174316  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.48 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  28.72 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  30.45 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  28.95 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  27.12 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  25.59 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.51 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  31.41 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  28.67 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  29.9 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  27.46 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2925  protein of unknown function DUF6, transmembrane  30.93 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  27.93 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  31.01 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  26.71 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  32.03 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4022  hypothetical protein  29.37 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  27.27 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.92 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>