More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3867 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  92.95 
 
 		 317 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  93.45 
 
 		 291 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  92.76 
 
 		 291 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  73.29 
 
 		 302 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  66.78 
 
 		 296 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  58.67 
 
 		 311 aa  305  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  56.31 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.26 
 
 		 303 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  38.2 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.13 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  39.41 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  40.45 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.79 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  35.52 
 
 		 300 aa  159  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  38.95 
 
 		 335 aa  158  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  37.94 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  34.41 
 
 		 294 aa  153  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  38.18 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  38.46 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  38.18 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  37.18 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  39.5 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  39.5 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  38.18 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  35.93 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  36.36 
 
 		 324 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  37.82 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  37.82 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  37.82 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4726  hypothetical protein  58.57 
 
 		 156 aa  149  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  38.91 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.3 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  37.98 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  37.98 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  38.49 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  38.43 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  39.1 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.63 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  37.55 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  36.36 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  33.68 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.42 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  36.4 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.8 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  35.91 
 
 		 312 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.91 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  38.35 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  40.22 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  34.47 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  34.13 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  35.16 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  35.71 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  35.66 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  28.52 
 
 		 312 aa  119  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  34.04 
 
 		 319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  33.91 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  31.73 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  37.09 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  40 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.92 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  28.24 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  34.63 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  36.84 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  34.08 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.4 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  33.09 
 
 		 379 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  33.56 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  35.46 
 
 		 364 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  31.9 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.82 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.29 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  35.19 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.43 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  30.5 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  30.99 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  31.54 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  32.54 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.93 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  28.62 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  32.49 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  29.76 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.16 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.92 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.81 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.53 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  35.38 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  27.94 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  32.86 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  27.07 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  25.67 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  39.58 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>