More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1099 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  82.27 
 
 		 335 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  73.88 
 
 		 298 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.58 
 
 		 324 aa  339  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  57.88 
 
 		 312 aa  322  6e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.88 
 
 		 312 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  61.99 
 
 		 301 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  57.39 
 
 		 298 aa  301  9e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  55.33 
 
 		 302 aa  292  6e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.51 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.51 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  50.34 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  50.66 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  50.66 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  52.65 
 
 		 308 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  52.98 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  52.98 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  50.35 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  52.67 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  49.66 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  54.26 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  50 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  49.5 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  50 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  50.52 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  49.65 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  49.65 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  49.65 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  45.67 
 
 		 298 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  47.19 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.18 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  46.58 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  41.98 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  48.06 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  41.36 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.3 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.9 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  41.54 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  39.41 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  38.69 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  35.52 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  39.18 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.38 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  31.99 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  36.9 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  35.17 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  35.31 
 
 		 319 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  34.97 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.81 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  39.02 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  38.64 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  39.21 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  38.26 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  36.73 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  37.55 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  36.56 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  35.89 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  39.93 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  37.45 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  39.93 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.21 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  38.55 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  31.97 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  36.45 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  34.7 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  36.4 
 
 		 294 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.9 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  28.72 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  34.31 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  34.7 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.02 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.45 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  33.56 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  35.19 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.89 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  35.55 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  32.25 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.95 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  32.9 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  33.81 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  33.56 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  33.08 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  45.76 
 
 		 119 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  32.21 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  30.72 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.56 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.23 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  32.98 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  29.39 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.41 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.41 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  25.08 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>