More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2136 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  573  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  39.04 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  34.95 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  34.28 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  35.64 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  35.05 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.91 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  34.63 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1236  hypothetical protein  36.94 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  28.91 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.04 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  32.4 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 		 367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  28.82 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.94 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  31.1 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  32.26 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.82 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  33.21 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  31.64 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  31.14 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  30.4 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  28.34 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  33.46 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  30.99 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.01 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  32.51 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  31.25 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 324 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  33.08 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  34.53 
 
 		 379 aa  95.9  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  31.25 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.54 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  31.27 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  30.3 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  29.76 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  29.86 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0490  hypothetical protein  28.4 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  31.38 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  28.12 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  31.01 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  30 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  30.38 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  30.33 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  27.78 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.76 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  28.9 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2925  protein of unknown function DUF6, transmembrane  33.11 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  30.42 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  30.04 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  25.35 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  28.47 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4412  hypothetical protein  28.87 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498323  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.89 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0570975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  26.48 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  30.66 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  28 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.174316  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  30.95 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  28.47 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1533  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.22 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.46 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  29.31 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  27.46 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  30.45 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  25.98 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  27.55 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0388  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  24.65 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.18 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  25.68 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  26.71 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  25.7 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>