More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2091 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  569  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.15 
 
 
319 aa  318  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  56.06 
 
 
311 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.74 
 
 
324 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.06 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  50.35 
 
 
292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  55.24 
 
 
304 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.48 
 
 
326 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.87 
 
 
300 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.76 
 
 
297 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.36 
 
 
301 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3855  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.08 
 
 
304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00441298  normal  0.0499961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.57 
 
 
301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.16 
 
 
310 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 
310 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  37.23 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  29.51 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  31.27 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  31.27 
 
 
298 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  32.75 
 
 
324 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  31.41 
 
 
302 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  30.3 
 
 
308 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  30.3 
 
 
308 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  30.14 
 
 
308 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  30.3 
 
 
308 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  30.06 
 
 
310 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.62 
 
 
308 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  32.38 
 
 
322 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  26.8 
 
 
300 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  28 
 
 
298 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  26.69 
 
 
312 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  30.3 
 
 
308 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  30.3 
 
 
308 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  30.99 
 
 
310 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  30.99 
 
 
310 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  30.99 
 
 
310 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  29.15 
 
 
294 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  30.14 
 
 
308 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  35.09 
 
 
295 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.68 
 
 
312 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  27.18 
 
 
302 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  31.23 
 
 
302 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  30.99 
 
 
310 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  30.99 
 
 
310 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  30.99 
 
 
310 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  32.68 
 
 
312 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  32.61 
 
 
301 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  28.92 
 
 
311 aa  99  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 
324 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.88 
 
 
290 aa  97.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  31.18 
 
 
304 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  30.14 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  28.34 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  32.01 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.66 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  29.66 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  28.72 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  29.68 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  29 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  29.77 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  28.52 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  30.64 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  35.19 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  29.24 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  32.04 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.52 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  28.47 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  29.67 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  31.91 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  24.55 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  31.03 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  27.53 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  29.3 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  31.03 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  30.41 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  27.88 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  28.04 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  27.94 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  31.01 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  28.62 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  32.06 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.13 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  29.93 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  28.22 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  30.1 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  27.8 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  26.64 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.65 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  28.83 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  24.56 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>