More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0553 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  573  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  37.46 
 
 
297 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  37.82 
 
 
319 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  38.1 
 
 
311 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  36.03 
 
 
299 aa  129  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  37.36 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  32.52 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  35.45 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  35.42 
 
 
319 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.11 
 
 
309 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.6 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 
307 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  38.46 
 
 
316 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  27.44 
 
 
290 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  29.6 
 
 
304 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  31.52 
 
 
306 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  34.88 
 
 
290 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.33 
 
 
305 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.33 
 
 
305 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  33.58 
 
 
321 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.1 
 
 
304 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  33.21 
 
 
321 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  32.85 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.27 
 
 
306 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  33.95 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  33.79 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  25.59 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  33.33 
 
 
297 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1236  hypothetical protein  30.74 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  32.97 
 
 
305 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.23 
 
 
301 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  34.26 
 
 
307 aa  89  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 
326 aa  89  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  33.56 
 
 
311 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.13 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.13 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.03 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  30.77 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  32.14 
 
 
310 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  27.76 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  31.87 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  28.73 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0388  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  29.63 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.55 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  32.89 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  31.08 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  30.36 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  32.39 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  24.75 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.51 
 
 
367 aa  79  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 
302 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0570975  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  31.47 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.72 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  30.31 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  29.84 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  34.25 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  31.83 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  30.67 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  31.71 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  28.86 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1542  hypothetical protein  28.77 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.89 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.174316  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  28.18 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  30.27 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.68 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  31.68 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  23.1 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  29.32 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  29.64 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  29.32 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  27.92 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  25.26 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.57 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2925  protein of unknown function DUF6, transmembrane  34.25 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  29.97 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  27.87 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  35.71 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  29.64 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  29.64 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  32.28 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  31.64 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  25.64 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  29.61 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  30.36 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  27.65 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  37.23 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>