More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5524 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.54 
 
 
308 aa  325  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  58.88 
 
 
322 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  56.52 
 
 
324 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  57.7 
 
 
308 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  57.7 
 
 
308 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  57.19 
 
 
310 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  57.93 
 
 
308 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  57.42 
 
 
308 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  57.42 
 
 
308 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  57.42 
 
 
308 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.39 
 
 
310 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.69 
 
 
310 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  54.66 
 
 
310 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  54.66 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  54.66 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  54.46 
 
 
302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  54.34 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  54.34 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  54.34 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  55.19 
 
 
308 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  55.41 
 
 
310 aa  262  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  45.82 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  48.26 
 
 
295 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  45.67 
 
 
310 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  45.61 
 
 
294 aa  227  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  45.64 
 
 
312 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  43.73 
 
 
298 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.64 
 
 
312 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  43.42 
 
 
335 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  45.52 
 
 
298 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  48.75 
 
 
301 aa  215  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.02 
 
 
324 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  39.06 
 
 
300 aa  205  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  44.69 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  41.61 
 
 
311 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  43.43 
 
 
295 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  39.79 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  39.45 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  37.98 
 
 
291 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.3 
 
 
303 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  38.2 
 
 
310 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  37.67 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  36.27 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  36.33 
 
 
298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.22 
 
 
290 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  31.49 
 
 
302 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  36.86 
 
 
304 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  36.54 
 
 
291 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.33 
 
 
299 aa  148  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  36.54 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  41.55 
 
 
303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  36.5 
 
 
317 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  36.64 
 
 
296 aa  145  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.03 
 
 
283 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  36.5 
 
 
296 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  34.32 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  31.95 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  34.03 
 
 
319 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 
319 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  32.49 
 
 
321 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  31.74 
 
 
304 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  32.13 
 
 
321 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  30.14 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  33.56 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  31.58 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  34.59 
 
 
379 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  45 
 
 
119 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  31.27 
 
 
301 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  30.86 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 
320 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 
307 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.68 
 
 
309 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  30.33 
 
 
294 aa  105  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 
301 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1542  hypothetical protein  30.74 
 
 
288 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 
300 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  34.18 
 
 
307 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 
304 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 
306 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  29.96 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  28.62 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  33.11 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  32.03 
 
 
334 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
313 aa  95.9  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  31.73 
 
 
301 aa  95.5  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  30.23 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  35.05 
 
 
364 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  30.51 
 
 
316 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.48 
 
 
301 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.18 
 
 
305 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.18 
 
 
305 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4726  hypothetical protein  38.19 
 
 
156 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  32.96 
 
 
320 aa  90.1  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  29.56 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  27.55 
 
 
290 aa  89  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  32.62 
 
 
289 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>