122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4726 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4726  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  294  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  62.84 
 
 		 303 aa  170  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  57.96 
 
 		 311 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  58.17 
 
 		 310 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  53.95 
 
 		 302 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  55.33 
 
 		 296 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  58.82 
 
 		 317 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  57.89 
 
 		 291 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  57.89 
 
 		 291 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.2 
 
 		 310 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  38.93 
 
 		 298 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.4 
 
 		 310 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  45.99 
 
 		 335 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.24 
 
 		 303 aa  92.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  44.09 
 
 		 298 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  43.26 
 
 		 300 aa  88.6  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  43.65 
 
 		 310 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  38.58 
 
 		 310 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  38.58 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  38.58 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  38.58 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  38.58 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  38.58 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  38.58 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  39.37 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  39.53 
 
 		 308 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  37.98 
 
 		 308 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  39.53 
 
 		 308 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  39.53 
 
 		 308 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  40.31 
 
 		 322 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  38.97 
 
 		 294 aa  80.5  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  45.31 
 
 		 310 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.76 
 
 		 308 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  42.14 
 
 		 302 aa  77.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  37.21 
 
 		 308 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  39.32 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  44.2 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  36.6 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  39.32 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.2 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.38 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  37.5 
 
 		 324 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  41.35 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  39.35 
 
 		 298 aa  73.9  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.45 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  37.88 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  52.31 
 
 		 295 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  40.74 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  52.11 
 
 		 295 aa  67.4  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 		 290 aa  67.4  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  45.26 
 
 		 301 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  38.46 
 
 		 379 aa  64.7  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  53.12 
 
 		 296 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  37.41 
 
 		 314 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  54.1 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  34.53 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  30.47 
 
 		 304 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.75 
 
 		 300 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44 
 
 		 324 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  44 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  33.81 
 
 		 319 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  35 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.16 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  29.03 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2400  hypothetical protein  42.5 
 
 		 294 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.37 
 
 		 319 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  40.79 
 
 		 325 aa  52.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  37.5 
 
 		 310 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  35.66 
 
 		 321 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  36.22 
 
 		 321 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  28.4 
 
 		 312 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.27 
 
 		 320 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  36 
 
 		 308 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  26.67 
 
 		 292 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.02 
 
 		 330 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal  0.0433001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.58 
 
 		 292 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  41.43 
 
 		 319 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  32.39 
 
 		 305 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.79 
 
 		 308 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.09 
 
 		 306 aa  48.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.61 
 
 		 306 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.9 
 
 		 315 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  38.57 
 
 		 315 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26 
 
 		 298 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  29.84 
 
 		 356 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.24 
 
 		 310 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  37.68 
 
 		 316 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  30.28 
 
 		 304 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.52 
 
 		 316 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 		 297 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.71 
 
 		 307 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 326 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 		 303 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  33.09 
 
 		 304 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  31.39 
 
 		 305 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  34.62 
 
 		 301 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  30.56 
 
 		 300 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3809  integral membrane protein  26.4 
 
 		 298 aa  44.3  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.770617  normal  0.329241 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>