More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1843 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  557  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  40.48 
 
 
311 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.73 
 
 
310 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.8 
 
 
310 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.17 
 
 
303 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  38.43 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  35.54 
 
 
302 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  34.95 
 
 
303 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  33.92 
 
 
300 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  32.32 
 
 
294 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  36.04 
 
 
310 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  39.86 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  36.24 
 
 
335 aa  138  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.03 
 
 
299 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  39.46 
 
 
310 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  39.46 
 
 
310 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  39.46 
 
 
310 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  34.88 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.72 
 
 
312 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  37.8 
 
 
301 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  37.54 
 
 
310 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  34.05 
 
 
297 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  39.13 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  39.13 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  32.38 
 
 
291 aa  132  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  37.37 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  36.33 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  32.06 
 
 
295 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  34.53 
 
 
310 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  38.8 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  34.27 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  37.37 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  36.86 
 
 
298 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  36.33 
 
 
310 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  37.37 
 
 
308 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  37.37 
 
 
308 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  37.04 
 
 
308 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  37.04 
 
 
308 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  37.71 
 
 
308 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  31.58 
 
 
298 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.68 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  34.89 
 
 
291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  34.6 
 
 
291 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  34.31 
 
 
296 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  33.78 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.33 
 
 
290 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  36.21 
 
 
295 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.42 
 
 
283 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  34.17 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.59 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  35.69 
 
 
322 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  34.26 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  35.94 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  36.52 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  29.28 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  32.89 
 
 
311 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  36.43 
 
 
303 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  28.28 
 
 
298 aa  105  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  33.8 
 
 
314 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  28.28 
 
 
312 aa  103  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
309 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  30.82 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  32.18 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.52 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  30.25 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  34.22 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  33.45 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  29.6 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  31.94 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  33.84 
 
 
321 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  32.43 
 
 
307 aa  89  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  32.36 
 
 
379 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
326 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  32.25 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  30.37 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  30.66 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  24.83 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  30.74 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  28.78 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  35.59 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  29.27 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  30.71 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  28.9 
 
 
320 aa  79  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  27.64 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.96 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  23.2 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  44.58 
 
 
119 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.99 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  28.72 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  25.17 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  29.3 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>