187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0764 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  100 
 
 		 119 aa  234  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  60.36 
 
 		 295 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.21 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.21 
 
 		 310 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  49.15 
 
 		 308 aa  114  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  50.85 
 
 		 308 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  49.15 
 
 		 310 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  49.15 
 
 		 302 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  49.15 
 
 		 310 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  49.15 
 
 		 310 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  49.15 
 
 		 310 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  49.15 
 
 		 310 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  49.15 
 
 		 310 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  48.31 
 
 		 308 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  48.31 
 
 		 308 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  45 
 
 		 298 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  48.31 
 
 		 310 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  46.55 
 
 		 308 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.72 
 
 		 308 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  49.14 
 
 		 302 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  46.72 
 
 		 322 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  51.28 
 
 		 310 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  47.41 
 
 		 324 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  45.76 
 
 		 310 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  43.75 
 
 		 335 aa  97.1  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  47.11 
 
 		 296 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  44.07 
 
 		 291 aa  91.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  44.04 
 
 		 298 aa  90.9  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  51.33 
 
 		 295 aa  90.1  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  41.07 
 
 		 294 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  37.29 
 
 		 300 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.99 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  48.15 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.05 
 
 		 290 aa  77  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.68 
 
 		 303 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  40.37 
 
 		 297 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.05 
 
 		 299 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  39.58 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  44.64 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  42.2 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.2 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  37.5 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.57 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  43.3 
 
 		 296 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  39.42 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  41.67 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  43.33 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  39.25 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  40.62 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  31.48 
 
 		 312 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4726  hypothetical protein  40.74 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  44.58 
 
 		 294 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  31.48 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 		 319 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  33.04 
 
 		 311 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  60.1  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  35.05 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  40 
 
 		 302 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  36.79 
 
 		 304 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  45.83 
 
 		 364 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.73 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.04 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  36.05 
 
 		 316 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  28.45 
 
 		 302 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  33.88 
 
 		 314 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.29 
 
 		 320 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  34.88 
 
 		 297 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  38.24 
 
 		 334 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  35.4 
 
 		 301 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 		 300 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 		 315 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  35.62 
 
 		 274 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  38.04 
 
 		 290 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  31.25 
 
 		 305 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  34.12 
 
 		 292 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.12 
 
 		 335 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  34.83 
 
 		 311 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  31.25 
 
 		 319 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  27.19 
 
 		 314 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  36.04 
 
 		 299 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.58 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  38.37 
 
 		 308 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  30.77 
 
 		 299 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  42.62 
 
 		 356 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1542  hypothetical protein  40.28 
 
 		 288 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36 
 
 		 367 aa  48.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  33.64 
 
 		 289 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  35 
 
 		 296 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.57 
 
 		 326 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.23 
 
 		 301 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  36.9 
 
 		 310 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  31.46 
 
 		 321 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 		 304 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4412  hypothetical protein  44 
 
 		 301 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498323  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  35.71 
 
 		 310 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  25.66 
 
 		 272 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>