More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1522 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  82.3 
 
 
308 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  81.5 
 
 
322 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  71.57 
 
 
310 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  71.81 
 
 
302 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  71.57 
 
 
310 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  71.57 
 
 
310 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  71 
 
 
308 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  71 
 
 
308 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  70.59 
 
 
310 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  71.24 
 
 
310 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  71.24 
 
 
310 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  71.24 
 
 
310 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  71.05 
 
 
308 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  69.33 
 
 
308 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  69.33 
 
 
308 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  69.33 
 
 
308 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  70.07 
 
 
308 aa  358  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  59.46 
 
 
298 aa  325  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.92 
 
 
310 aa  288  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.58 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  51.86 
 
 
302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  54.24 
 
 
310 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  47.85 
 
 
310 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  46.55 
 
 
335 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  45.67 
 
 
298 aa  238  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  46.75 
 
 
312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.75 
 
 
312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.02 
 
 
324 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  48.67 
 
 
295 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  44.03 
 
 
294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  50.35 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  48.62 
 
 
301 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  45.92 
 
 
298 aa  215  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  39.81 
 
 
300 aa  212  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  42.52 
 
 
295 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  40.42 
 
 
297 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  38.85 
 
 
291 aa  176  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  38.57 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  40 
 
 
296 aa  172  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.74 
 
 
290 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  37.84 
 
 
311 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  36.7 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  35 
 
 
312 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.51 
 
 
303 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  35.92 
 
 
298 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  38.27 
 
 
304 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.8 
 
 
299 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  37.11 
 
 
302 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  38.1 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  38.1 
 
 
291 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.71 
 
 
283 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  34.57 
 
 
319 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  33.01 
 
 
311 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  36.57 
 
 
296 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  35.2 
 
 
317 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  40.57 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  30.84 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  32.61 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  31.58 
 
 
321 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.42 
 
 
319 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  33 
 
 
304 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  33.78 
 
 
294 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  34.63 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 
320 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  32.55 
 
 
314 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  34.57 
 
 
290 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  32.98 
 
 
301 aa  112  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 
301 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  35.11 
 
 
311 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  47.41 
 
 
119 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.39 
 
 
301 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  35.81 
 
 
364 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 
324 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  33.22 
 
 
379 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.03 
 
 
324 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  30.43 
 
 
314 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.24 
 
 
309 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  30.48 
 
 
301 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  31.6 
 
 
305 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 
313 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  30.24 
 
 
307 aa  99.4  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  30.41 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  32.29 
 
 
308 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  33.56 
 
 
316 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  35.66 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  30.67 
 
 
295 aa  89.7  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  25.84 
 
 
294 aa  89.4  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 
326 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  33.33 
 
 
304 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 
297 aa  86.3  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  29.75 
 
 
292 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 
304 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  29.43 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  32.53 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  31.46 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  27.46 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>