More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0876 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 306 aa  585  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.79 
 
 		 307 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.25 
 
 		 304 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  66.79 
 
 		 297 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  65.33 
 
 		 301 aa  341  9e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  62.77 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  66.06 
 
 		 320 aa  328  9e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.04 
 
 		 305 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.04 
 
 		 305 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  62.55 
 
 		 310 aa  308  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  39.3 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  38.85 
 
 		 314 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  39.72 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  38.81 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.05 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  39.3 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  34.22 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  36.23 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  35.11 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  33.68 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  41.4 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  35.87 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.38 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.07 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  32.95 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  34.07 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  31.58 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  34.95 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  32.62 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.13 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  34.72 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  32.04 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  35.71 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  34.33 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  33.45 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.87 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  32.58 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  35.71 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  35.71 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  35.25 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  31.49 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  34.75 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  32.97 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  35.97 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  35.27 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.83 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  29.6 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  34.59 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  35.07 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  34.83 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  34.58 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  34.58 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  35.06 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  32.23 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  31.67 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  34.59 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  34.59 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  34.59 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  34.59 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  34.59 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  34.59 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.55 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  35.11 
 
 		 364 aa  99  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  31.96 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  31.96 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  31.96 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  31.87 
 
 		 379 aa  97.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  33.7 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  32.14 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  32.63 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  36.09 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  31.39 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  32.52 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  32.64 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  34.21 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 		 324 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  27.11 
 
 		 311 aa  92.4  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  32.52 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.66 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.29 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.83 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  32.27 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  27.68 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  33.21 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.47 
 
 		 324 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  27.24 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  27.43 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  30.45 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  32.4 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  32.4 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  33.58 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  31.47 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  32.53 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.96 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  28.11 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  25.34 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>