More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3091 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 309 aa  587  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.19 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  42.86 
 
 		 379 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  41.55 
 
 		 289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  41.49 
 
 		 364 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  39.05 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.14 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  42.11 
 
 		 356 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  33.46 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  37.21 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  36.58 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  36.64 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.89 
 
 		 330 aa  119  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  36.11 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  37.15 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  31.46 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  36.73 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.73 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.51 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.2 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.99 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  31.97 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  36.11 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.27 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  36.36 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  36.73 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  35.04 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  32.98 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  35.16 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  34.68 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  32.97 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  36.23 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  32.14 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  34.83 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  34.22 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  35 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  32.4 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  30.9 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  33.2 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  35.84 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.01 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.174316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.69 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  35.59 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.21 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  35.66 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  32.74 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.09 
 
 		 324 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  32.82 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.33 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  33.22 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  34.58 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  32.74 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.24 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2925  protein of unknown function DUF6, transmembrane  35.77 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  32.87 
 
 		 291 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4446  hypothetical protein  30.41 
 
 		 311 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.61 
 
 		 324 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0388  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.27 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  33.57 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  33.22 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.12 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  35.37 
 
 		 308 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  35.37 
 
 		 308 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  30.03 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.23 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  29.58 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  32.39 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  34.89 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  35 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  29.86 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3207  hypothetical protein  30.07 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  30.39 
 
 		 295 aa  85.9  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  34.35 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.13 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  35.17 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  34.83 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4953  hypothetical protein  29.73 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  34.33 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  33.45 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  29.14 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  33.99 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  31.62 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1542  hypothetical protein  29.55 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  25.72 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1236  hypothetical protein  31.07 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  33.44 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  34.35 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  34.35 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  34.35 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>