276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1417 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  73.29 
 
 		 310 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  74.32 
 
 		 291 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  74.32 
 
 		 291 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  72.95 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  68.14 
 
 		 296 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  59.59 
 
 		 311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  59.31 
 
 		 303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.99 
 
 		 303 aa  185  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  37.67 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  35.44 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.24 
 
 		 310 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  41.57 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  37.84 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  35.05 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  37.23 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  37.74 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  37.1 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  37.1 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4726  hypothetical protein  53.47 
 
 		 156 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.59 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  37.34 
 
 		 302 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.72 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  37.1 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  37.1 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  38.11 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  37.17 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  37.07 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  37.42 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  33.45 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  36.88 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  37.11 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  36.88 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  36.88 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  37.23 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.46 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  38.14 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  38.7 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  36.54 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  37.55 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  38.85 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.66 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  35.61 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.66 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  35.66 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  38.43 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  38.38 
 
 		 322 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.59 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  39.64 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  34.88 
 
 		 294 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  37.89 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  34.2 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  35.96 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  32.53 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  34.28 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  32.98 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  34.63 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  27.18 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  32.1 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  27.8 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  38.6 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.66 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  32.97 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  27.48 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  33.21 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.44 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  33.09 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  32.18 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  31.46 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  31.09 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  31.49 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  29.17 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.92 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.75 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  28.82 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  29.68 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  25.38 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  30.99 
 
 		 364 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  29.66 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  29.96 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  28.29 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.4 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.14 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  31.03 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  25.38 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  28.04 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.32 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.46 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  30.48 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>