More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0672 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  50.34 
 
 		 311 aa  258  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  47.62 
 
 		 310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  47.62 
 
 		 310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  42.71 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  39.39 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  39.58 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.66 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  43.54 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.06 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.79 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  39.12 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  37.46 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  43.07 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  41.64 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  29.59 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  28.77 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  29.25 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  34.27 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  29.39 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  28.98 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  27.6 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  27.6 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  27.24 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  27.82 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  27.24 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  27.24 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  27.24 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  26.88 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  27.24 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  27.24 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  30.64 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.94 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  32.96 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  31.21 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.33 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  30.35 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  30.85 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.05 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.61 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  29.97 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  30.63 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 		 309 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  25.89 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.78 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  30.51 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.33 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal  0.0433001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  29.12 
 
 		 329 aa  95.9  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.15 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25.17 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  28.83 
 
 		 307 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  31.65 
 
 		 219 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  30.69 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  28.47 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  30.13 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  29.79 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  28.57 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  29.08 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  26.9 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  29.89 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  27.15 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  29.89 
 
 		 293 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  30.86 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  29.18 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  27.05 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  28.52 
 
 		 294 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  29.23 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  31.69 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.96 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  30.9 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  26.62 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.76 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  32.41 
 
 		 310 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  29.79 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.26 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 		 286 aa  86.3  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  27.52 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  30.38 
 
 		 324 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  32.01 
 
 		 287 aa  85.9  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  26.12 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  25.62 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  31.34 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  25.62 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  29.89 
 
 		 290 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  27.24 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>