More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0277 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
325 aa  640    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.9 
 
 
292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  51.19 
 
 
305 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  49.65 
 
 
289 aa  261  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  50.87 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.81 
 
 
292 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  42.38 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  43.24 
 
 
310 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  42.91 
 
 
310 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  40.92 
 
 
315 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  39.6 
 
 
304 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  39.79 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  41.67 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  35.86 
 
 
328 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  38.91 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  34.47 
 
 
312 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  30.42 
 
 
309 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  30.04 
 
 
309 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  30.07 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  30.21 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  31.36 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.74 
 
 
310 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  32.06 
 
 
310 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  31.4 
 
 
310 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  32.34 
 
 
310 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  25.26 
 
 
299 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.97 
 
 
299 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  29.87 
 
 
301 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  24.91 
 
 
299 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  31.62 
 
 
302 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  29.82 
 
 
303 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  30.85 
 
 
303 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  30.88 
 
 
303 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  29.61 
 
 
309 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  30.65 
 
 
300 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  30.38 
 
 
303 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  29.82 
 
 
303 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  28.71 
 
 
319 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  29.82 
 
 
303 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  30.07 
 
 
303 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  29.82 
 
 
303 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  30.18 
 
 
303 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  29.47 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28.04 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  29.12 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
286 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  30.43 
 
 
307 aa  96.7  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  27.11 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  25 
 
 
294 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.2 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  28.47 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.65 
 
 
294 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  27.05 
 
 
305 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  25.44 
 
 
297 aa  89.7  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.41 
 
 
305 aa  89.7  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  25 
 
 
294 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  24.91 
 
 
294 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  24.91 
 
 
294 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.98 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  25.34 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  27.24 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  30.14 
 
 
219 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  24.65 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 
289 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  27.24 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
300 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  28.76 
 
 
310 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  27.24 
 
 
313 aa  87  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  24.91 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  30.97 
 
 
310 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  26.9 
 
 
303 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  26.55 
 
 
303 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  26.9 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  26.9 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  25.51 
 
 
304 aa  85.9  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  25.25 
 
 
309 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  31.1 
 
 
312 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  26.1 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  26.55 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  31.38 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  29.83 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  25.68 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.86 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  31.21 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.05 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  26.1 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  28.18 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  26.21 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  21.16 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  28.08 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  27.93 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  26.96 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>