247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1591 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  64.21 
 
 		 290 aa  323  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  58.92 
 
 		 321 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  58.39 
 
 		 321 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  44.44 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  44.41 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  45.45 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  44.26 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  41.64 
 
 		 304 aa  191  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  45.3 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.54 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  45.15 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  40.43 
 
 		 314 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  35.13 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.98 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.03 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  34.46 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.83 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  33.95 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.16 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.71 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.45 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.45 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  36 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  33.58 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  36.52 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  38.11 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  31.77 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  31.16 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  35.76 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.76 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  35.64 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  36.59 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  32.84 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.36 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  31.32 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  31.72 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  32.25 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  33.11 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  35.25 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  34.93 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  29.97 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  31.06 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  32.2 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  32.2 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  32.2 
 
 		 310 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  32.2 
 
 		 310 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  34.33 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  31.53 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.26 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  31.56 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  31.62 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  31.25 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  31.97 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  31.97 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  31.23 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  31.44 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  31.44 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  31.44 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.69 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  31.9 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  31.36 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  31.66 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  29.82 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  30.66 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  30.33 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  33.45 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  30.25 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  31.46 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  32.48 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  31.91 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  30.43 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  35.78 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  31.13 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  33.7 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  31.13 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  28.74 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1236  hypothetical protein  29.41 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  31.97 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  30.6 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  33.09 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  28.05 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  29.55 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.46 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  25.68 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  28.62 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.02 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.07 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  26.98 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>