More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0243 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  598  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  75.75 
 
 		 312 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  72 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.11 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  49.18 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.26 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  35.74 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2802  hypothetical protein  34.6 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  35.74 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  35.74 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.6 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  33.82 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  33.22 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  35.59 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  31.65 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  31.68 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  34.55 
 
 		 298 aa  96.3  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  31.01 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  30.27 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  31.23 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 348 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  30.85 
 
 		 296 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.88 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  30.94 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4196  hypothetical protein  34.31 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  30.27 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  32.56 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  35.13 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 307 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 		 325 aa  85.9  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  29.12 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  28.32 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  28.42 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  31.01 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  30.22 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  32.73 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.37 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  31.4 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  31.33 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  30.33 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  28.57 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.85 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  27.58 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.13 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  28.08 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  30.34 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  29.32 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  30.62 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  28.68 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  28.67 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  30.82 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.18 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  27.66 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  31.65 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  27.9 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  29.89 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.63 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  34.66 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  28.27 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  25.27 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  25.72 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  26.16 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  29.82 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  25.63 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.63 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  27.43 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  27.86 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  27.94 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.27 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.26 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  28.87 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.43 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1245  putative permease  30.23 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  24.91 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  24.91 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  24.91 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  24.91 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.85 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.29 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  24.91 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_002620  TC0869  hypothetical protein  27.21 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>