More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2203 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  95.25 
 
 
324 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  95.56 
 
 
324 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  73.31 
 
 
304 aa  338  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  54.83 
 
 
301 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  54.29 
 
 
292 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.91 
 
 
319 aa  255  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.67 
 
 
300 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.57 
 
 
326 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.31 
 
 
301 aa  215  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.36 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3855  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.48 
 
 
304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00441298  normal  0.0499961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.62 
 
 
301 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.46 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 
310 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  30.69 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  35.5 
 
 
310 aa  116  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.5 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  32.07 
 
 
300 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  33.57 
 
 
335 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  34.59 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  34.59 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  34.25 
 
 
308 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  32.69 
 
 
310 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  32.85 
 
 
308 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  32.19 
 
 
308 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  32.19 
 
 
308 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  33.94 
 
 
308 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  33.67 
 
 
310 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  34.41 
 
 
298 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.78 
 
 
312 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  25.85 
 
 
312 aa  102  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  33.46 
 
 
312 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  31.9 
 
 
310 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  31.9 
 
 
310 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  31.9 
 
 
310 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  31.93 
 
 
302 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.08 
 
 
308 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  33.69 
 
 
324 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  33.68 
 
 
301 aa  99.4  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  31.9 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  31.9 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  31.9 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  33.45 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  30.9 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  33.08 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  31.05 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  32.33 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  27.3 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  30.66 
 
 
295 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.74 
 
 
313 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  28.52 
 
 
311 aa  93.2  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  32.89 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  31.05 
 
 
302 aa  92.4  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  31.45 
 
 
319 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  26.01 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  31.95 
 
 
297 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  32.39 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 
307 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.7 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  35.32 
 
 
295 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 
320 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  33.56 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.89 
 
 
309 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 
324 aa  85.9  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  28.47 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  28.42 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  31.42 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  31.72 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  28.36 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  30.9 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  31.32 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0388  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  29.69 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  31.79 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  30.07 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 
283 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  31.12 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  28.36 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  29.41 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  31.56 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  28.21 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  27.8 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  29.41 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  31.96 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  25 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  33.1 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  33.63 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  29.51 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  29.49 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  29.59 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  31.74 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  35.29 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>