More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2561 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  602  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  65.37 
 
 		 319 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  64.65 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  66.67 
 
 		 319 aa  351  7e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  60.7 
 
 		 301 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  55.41 
 
 		 304 aa  312  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  60.63 
 
 		 316 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.16 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  48.21 
 
 		 314 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.15 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  48.18 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  48.18 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  44.95 
 
 		 308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  45.15 
 
 		 307 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.81 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  44.85 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  44.71 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  38.46 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.79 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.79 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.85 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  38.18 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.44 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  36.01 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  39.34 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  36.86 
 
 		 304 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  38.52 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.27 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.91 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  36.08 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  34.65 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  39.27 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  35.89 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  37.2 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  34.71 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  36.18 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.63 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  34.02 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  37.32 
 
 		 312 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  34.63 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  36.2 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  35.6 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  36.36 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  33.91 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  36.81 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  35.99 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  35.05 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.14 
 
 		 303 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  34.04 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  37.82 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  37.36 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.23 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.15 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.25 
 
 		 324 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  35.52 
 
 		 364 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  32.15 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  35.53 
 
 		 298 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.83 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  34.67 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  32.8 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  32.8 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  33.86 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  33.86 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  32.91 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  35.48 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  36.36 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.43 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  36.52 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  36.52 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  31.7 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  32.21 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  31.8 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  32.21 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  32.89 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  27.27 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  39.83 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  32 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0431  hypothetical protein  63.74 
 
 		 92 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  31.88 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  31.88 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  31.88 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  35.23 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  31.05 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  33.96 
 
 		 356 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  32.66 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  31.82 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  27.09 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  26.71 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  31.74 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  33.8 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  36.68 
 
 		 296 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1236  hypothetical protein  28.89 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.55 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>