More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4793 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
300 aa  570  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  63.99 
 
 
292 aa  334  9e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  51.4 
 
 
311 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.69 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.83 
 
 
324 aa  231  9e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.7 
 
 
319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  45.81 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.69 
 
 
326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.51 
 
 
297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  51.59 
 
 
304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.26 
 
 
301 aa  185  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3855  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.64 
 
 
304 aa  172  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00441298  normal  0.0499961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.56 
 
 
301 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  33.11 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 
310 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  34.03 
 
 
301 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  32.39 
 
 
294 aa  119  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.42 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  32.5 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  33.88 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  32 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  31.38 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  28.98 
 
 
311 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  30.14 
 
 
308 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  30.14 
 
 
308 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  30.14 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  30.14 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  30.71 
 
 
335 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  29.79 
 
 
308 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  30.17 
 
 
308 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  26.71 
 
 
302 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  29.02 
 
 
300 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  30.11 
 
 
298 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  30.17 
 
 
310 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  30.36 
 
 
319 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  33.09 
 
 
297 aa  99.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  29.45 
 
 
308 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  30.18 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  30.71 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 
326 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  30.71 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  30.71 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  30.27 
 
 
302 aa  96.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  30.71 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  30.71 
 
 
310 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  30.71 
 
 
310 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  28.29 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.58 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  33.11 
 
 
379 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.88 
 
 
313 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.98 
 
 
324 aa  92.8  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  31.37 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  28.84 
 
 
305 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  30.55 
 
 
314 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  32.22 
 
 
301 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.84 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.84 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  26.13 
 
 
290 aa  85.9  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  30.85 
 
 
297 aa  85.5  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  31.27 
 
 
295 aa  85.5  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  28.99 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  28.23 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  29.72 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  31.35 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  31.65 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  25.19 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.13 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  30.72 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  33.66 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.96 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  31.56 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  28.21 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  27.62 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  29.31 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  32.37 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  28.09 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  30.74 
 
 
316 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  30.9 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  30.04 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  32.42 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.75 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  26.86 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  30.6 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  23.76 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  31.18 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  30.58 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  22.85 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  31.41 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>