More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1011 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  541  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  36.99 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  37.15 
 
 		 301 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  36.64 
 
 		 301 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  36.64 
 
 		 301 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  36.64 
 
 		 301 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  36.64 
 
 		 301 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  36.64 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  36.64 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  36.64 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  36.73 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  32.98 
 
 		 312 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  34.69 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25.53 
 
 		 316 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  33.68 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  32.16 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  33.45 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  31.58 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  32.04 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.23 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  32.66 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  34.49 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.56 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  30.69 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  30.85 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  33.72 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  31.97 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  33.56 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  29.72 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  30.55 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  27.51 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  32.21 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.32 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  30.18 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  28.81 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.83 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  33.69 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  28.47 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  33.09 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.17 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  31.25 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  31.25 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  31.86 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.54 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.55 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  29.55 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  34.88 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  30.91 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  30 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  28.07 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  30.58 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  34.36 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.95 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  31.25 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  31.32 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.46 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  27.72 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  27.72 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  27.72 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  27.72 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  27.72 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  31.8 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  28.77 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  30.93 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  28.77 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  33.45 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  27.37 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  31.79 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  23.76 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  27.11 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  30.51 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  28.94 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  28.67 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  32.06 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  30.77 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  29.07 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  28.37 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  33.21 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  29.93 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.97 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  32.28 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.75 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>