More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0490 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  613  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  78.11 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  76.79 
 
 		 305 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  78.98 
 
 		 307 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  62.78 
 
 		 317 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  46.26 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  44.52 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.17 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.17 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.9 
 
 		 293 aa  206  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.71 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  45.33 
 
 		 303 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  43.61 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  44.75 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  46.58 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  43.51 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  43.51 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  43.51 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  42.86 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  42.86 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  42.52 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  45.67 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  45.67 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  45.67 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  45 
 
 		 311 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  42.47 
 
 		 301 aa  188  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  45.05 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  44.29 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  43 
 
 		 302 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  40.79 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  42.71 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  38.46 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  39.66 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  41.55 
 
 		 303 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  41.55 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  38.46 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.92 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  43.51 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  37.37 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  37.1 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  39.46 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  42.68 
 
 		 272 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  42.68 
 
 		 272 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  39.53 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  40.67 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  36 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  34.58 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  34.27 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  35.44 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  36.73 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  35.71 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  30.66 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  29.73 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.4 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  32.56 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  27.27 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  26.1 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  25.34 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  25.08 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  25.68 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  25.09 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  32.66 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  32.32 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.16 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  26.44 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  29.34 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.43 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  28.62 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  26.55 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.15 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.09 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  30 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  27.31 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  30 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  28.3 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  24.39 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  27.85 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  26.09 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  31.64 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  29.67 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  28.27 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06161  SMR family transporter  28.42 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.1 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  28.87 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  25.5 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  27.46 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  27.74 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>