More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4618 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  35.71 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.34 
 
 		 341 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.413764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  30.94 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.42 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  31.8 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2363  hypothetical protein  31.01 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.847183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  29.04 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  28.68 
 
 		 303 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  27.41 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02797  hypothetical protein  29.24 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.605573  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  30.14 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  30.86 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  30.58 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  31.4 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  31.4 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  31.4 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  31.4 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  31.4 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  31.4 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  31.4 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.57 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  27.72 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  32.27 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  30.3 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  26.81 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  32.2 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4618  hypothetical protein  29.66 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  24.69 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0825  hypothetical protein  29.65 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  29.52 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  31.28 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  26.22 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  24.72 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  28.17 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.23 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  25.84 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  30.3 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  28.47 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.29 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  29.52 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  24.4 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  24.33 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  27.92 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  27.71 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.32 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  25.84 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  29.27 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  25.84 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  29.03 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.8 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  25.19 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  26.04 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  23.46 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  29.11 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  31.3 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  24.88 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  31.69 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  24.63 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.45 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  24.02 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  30 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  24.88 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  24.88 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  24.88 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  24.88 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  30 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  24.39 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  26.03 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  22.59 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  29.33 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  24.63 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  28.03 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  24.71 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  22.69 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.7 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  27.78 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  29.3 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  29.96 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  28 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>