More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4236 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  100 
 
 		 297 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.76 
 
 		 299 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  67.93 
 
 		 299 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  61.74 
 
 		 299 aa  333  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  59.06 
 
 		 299 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  53.1 
 
 		 299 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  51.18 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.74 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  31.14 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  28.42 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  29.14 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  34.18 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  33.83 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0825  hypothetical protein  29.5 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  27 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  27 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  27 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  27 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  27 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  27.67 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.67 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.33 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  28 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.66 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  27.27 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4618  hypothetical protein  29.21 
 
 		 298 aa  89.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  29.43 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  29.43 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  29.43 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  29.43 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  29.43 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  29.43 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  29.29 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  31.65 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  29.14 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.94 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  29.65 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  27.84 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  27.91 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.78 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.78 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.4 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.4 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.4 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.42 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.64 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  24.06 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  30.66 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  30.69 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.4 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.64 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.02 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.13 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  31.23 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  23.19 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.92 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  28.98 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  26.42 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  28.9 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  22.78 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  23.83 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  32.51 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  29.6 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  30.73 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.49 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  33.5 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  27.86 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  30.13 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  31.55 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.01 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2363  hypothetical protein  28.05 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.847183  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  23.57 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  26.97 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  25.91 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  29.26 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  28.33 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.38 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  26.97 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.8 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  27.7 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  27.7 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  28.82 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  27.7 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  24.71 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  23.65 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  26.78 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  26.57 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  21.58 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>