More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2020 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  634    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  38.27 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  38.27 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  38.95 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1859  integral membrane protein  40 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1972  hypothetical protein  40 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  36.11 
 
 		 303 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  37.63 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  35.42 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  30.49 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  30.71 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  26.33 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  26.97 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  27.34 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  27.92 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  26.26 
 
 		 305 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  26.87 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  26.87 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  27.24 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  26.87 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  29.32 
 
 		 395 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  29.32 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  29.5 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  29.5 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  29.5 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  29.12 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  29.5 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  27.64 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  28.46 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  27.69 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  27.69 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  27.08 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  25.77 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  27.08 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  27.69 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 		 302 aa  89.4  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.31 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  24.56 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  26.16 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  27.95 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  26.3 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  26.67 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.38 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  26.71 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.44 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  28.44 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.9 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  29.29 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  29.49 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.38 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  30.2 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  30.2 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  25.48 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  26.27 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  30.2 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  28.26 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  29.6 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  28.85 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.46 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  26.09 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  26.49 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  28.47 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  27.45 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  29.6 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  26.1 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  25.75 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  28.12 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  25 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3775  hypothetical protein  28.25 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  27.24 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  30.69 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.69 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  27.02 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  30.95 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  28.06 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  29.39 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  29.39 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  29.49 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  29.39 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.62 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  29.49 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  29.39 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  25.93 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  29.39 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  29.8 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  26.96 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>