233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2211 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  584  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  48.58 
 
 		 309 aa  262  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  44.13 
 
 		 307 aa  221  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  43.93 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.89 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  40.89 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.93 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  39.58 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.72 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  40.62 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  41.58 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.93 
 
 		 299 aa  198  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  41.16 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  39.71 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  39.71 
 
 		 395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  39.71 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  41.1 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  40.14 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  39.35 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  39.35 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  39.35 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  39.35 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.31 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  37.02 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  40.79 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.7 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.55 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  39.71 
 
 		 298 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  39.71 
 
 		 298 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  40.97 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.22 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  40.46 
 
 		 296 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  40.84 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  40.84 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  40.84 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  36.84 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  40.42 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  41.07 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  40 
 
 		 298 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  39.64 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  32.52 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  40.66 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.77 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  32.43 
 
 		 303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  41.43 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  32.43 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  33.81 
 
 		 309 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  32.09 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  40.36 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  32.8 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  32.62 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  35.46 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  32.37 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  29.27 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  26.3 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  30.77 
 
 		 318 aa  85.5  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  26.17 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  30.28 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  29.93 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  27.2 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  25.48 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  26.95 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1972  hypothetical protein  22.14 
 
 		 312 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1859  integral membrane protein  22.14 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.07 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  23.19 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  26.74 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  22.43 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  22.43 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  24.9 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  26.83 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  27.64 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  27.64 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  27.64 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  27.64 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  25.91 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  25.91 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  25.29 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  23.91 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  26.99 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  24.39 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  26.99 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  26.99 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0216  hypothetical protein  28.06 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.030228  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.78 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  26.74 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  27.66 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>