183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0497 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  616  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  54.24 
 
 
307 aa  290  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  39.16 
 
 
296 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  37.89 
 
 
414 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  38.28 
 
 
296 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  39.31 
 
 
296 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  39.31 
 
 
296 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  39.31 
 
 
316 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  39.31 
 
 
296 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  39.31 
 
 
296 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  39.31 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  36.55 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  36.55 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  38.06 
 
 
299 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.84 
 
 
299 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  37.08 
 
 
296 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.83 
 
 
298 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  37.36 
 
 
296 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  35.92 
 
 
307 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  37.36 
 
 
296 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  37.36 
 
 
296 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  35.53 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  32.29 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  31.53 
 
 
300 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  28.47 
 
 
300 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.48 
 
 
300 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.08 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  34.62 
 
 
301 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  31.74 
 
 
298 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  31.34 
 
 
298 aa  129  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  33.68 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  32.88 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.06 
 
 
303 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  32.4 
 
 
303 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  32.06 
 
 
303 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  33.74 
 
 
284 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  31.71 
 
 
303 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  32.75 
 
 
308 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.09 
 
 
300 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  30.17 
 
 
301 aa  122  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  28.42 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  31.03 
 
 
301 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  32.77 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  31.86 
 
 
300 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  32.13 
 
 
309 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  34.05 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  31.16 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  32.87 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  34.25 
 
 
300 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  31.23 
 
 
300 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
295 aa  95.9  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 
308 aa  93.2  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  28.36 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  24.23 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  24.91 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  24.91 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  32.56 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  29.56 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.98 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  23.39 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  30.04 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 
313 aa  59.7  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  26.67 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  23.43 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  25.78 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  23.38 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 
293 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  24.65 
 
 
312 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  27.24 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  27.94 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  25.72 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.94 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  25.39 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0216  hypothetical protein  36.94 
 
 
296 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.030228  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.27 
 
 
296 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 
348 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1859  integral membrane protein  21.64 
 
 
307 aa  52.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  25.32 
 
 
293 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1972  hypothetical protein  22.18 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.54 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.97 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.53 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.22 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.47 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  26.22 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.45 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  27.24 
 
 
299 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.9 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  28.35 
 
 
299 aa  49.7  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  25.18 
 
 
274 aa  49.7  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 
356 aa  49.3  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  35.29 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.39 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  31.62 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>