More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00646 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  100 
 
 		 317 aa  627  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  64.88 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  65.32 
 
 		 303 aa  381  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  47.56 
 
 		 314 aa  262  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  48.92 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  48.92 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1859  integral membrane protein  48.38 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1972  hypothetical protein  46.1 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  37.63 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  28.83 
 
 		 414 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  28.11 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  28.11 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  28.11 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  27.76 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  27.76 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  27.76 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  27.76 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  28.42 
 
 		 298 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  28.42 
 
 		 298 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  29.17 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  29.17 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  29.17 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  28.84 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.12 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.67 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  28.67 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  26.52 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  25.64 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  25.74 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  25.74 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  25.69 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  25.74 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  26.09 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  25.27 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  26.1 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  26.91 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  26.91 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  25.56 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  28.76 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.26 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  25.1 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  27.11 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  25.09 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.96 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  25.42 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  24.82 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.84 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  27.1 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  27.1 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  28.4 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  26.7 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  26.17 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  22.08 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  27.3 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  24.15 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  27.06 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  27.75 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  26.67 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  22.85 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  27.56 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  24.18 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  29.02 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  26.04 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  27.14 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  27.14 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  27.14 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  27.14 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  26.49 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.95 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  25.95 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  27.48 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  25.95 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  25.95 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  25.95 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  25.52 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0216  hypothetical protein  30.53 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.030228  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  23.42 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  25.57 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  26.22 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  24.07 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  27.81 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  24.91 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.38 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  25.36 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>