218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2418 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  80.55 
 
 		 298 aa  471  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  76.12 
 
 		 299 aa  427  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  63.67 
 
 		 298 aa  348  9e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  61.94 
 
 		 301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  52.25 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  51.5 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  51.35 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  52.36 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  53.1 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  52.08 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  50.68 
 
 		 300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  48.78 
 
 		 414 aa  247  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.86 
 
 		 300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  51.19 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  48.78 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  48.78 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  48.78 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  48.78 
 
 		 296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  48.78 
 
 		 296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  48.78 
 
 		 296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  48.78 
 
 		 316 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  49.3 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  53.68 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  53.42 
 
 		 300 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  46.37 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  48.95 
 
 		 298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  48.95 
 
 		 298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.88 
 
 		 299 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  48.61 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.14 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.86 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  44.86 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  49.3 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  49.3 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  49.3 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  44.86 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  49.13 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  44.52 
 
 		 303 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  47.26 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.4 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  44.44 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.52 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  40.89 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  42.91 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  41.11 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  40.53 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  36.55 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.58 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  34.6 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  42.48 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  32.99 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  34.88 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  32.43 
 
 		 319 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  26.95 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  29.47 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  28.15 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  27.89 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.8 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.03 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  28.49 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  25.95 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  25.69 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  25.81 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  28.21 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  26.52 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  23.83 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  27.31 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  27.31 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  27.31 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  27.31 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.49 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  26.44 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  26.44 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  27.09 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  27.61 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1972  hypothetical protein  23.68 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  30.82 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  26.92 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  27.61 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1859  integral membrane protein  24.44 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  23.16 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.68 
 
 		 340 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  27.61 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  28.78 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  23.16 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  23.76 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  23.76 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.24 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  25.09 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  25.75 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.66 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  24.08 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  25.35 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.03 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  24.45 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>