114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3370 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  49.62 
 
 		 307 aa  226  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  44.49 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  43.56 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  41.06 
 
 		 303 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  40.93 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  41.06 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  39.69 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.71 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.48 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  40.68 
 
 		 303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  44.13 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  44.13 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  42.47 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  45.49 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  42.02 
 
 		 300 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.97 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  44.79 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  44.79 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  44.79 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  44.79 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  44.79 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  44.79 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  43.58 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  43.46 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  41.38 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  44.4 
 
 		 414 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  43.24 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.85 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.6 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  41.86 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  44.79 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  44.79 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  44.79 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  40.98 
 
 		 308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.23 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  41.26 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  44.02 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  44.1 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  37.25 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.08 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  44.53 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  42.08 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  45.27 
 
 		 300 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  41.64 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  36.54 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  35.34 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  35.98 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  38.49 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.75 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.04 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.79 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  33.58 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  34.9 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  28.35 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  28.21 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2802  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  28.04 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.66 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.9 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  28.75 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  28.04 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  26.39 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  27.98 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  25.1 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  28.68 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  29 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.34 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.07 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.02 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  23.83 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  25.14 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  29.48 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  29.48 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  29.48 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  29.48 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  44.26 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  24.71 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4022  hypothetical protein  28 
 
 		 303 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 		 301 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  30.09 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  27.44 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  31.45 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  27.27 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  29.08 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  22.61 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.31 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  23.91 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.63 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.18 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  38.82 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  30.17 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  28.52 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>