234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1214 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  100 
 
 		 300 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  96 
 
 		 300 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  80.62 
 
 		 300 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  77.47 
 
 		 301 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  81.38 
 
 		 298 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  80.97 
 
 		 300 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  83.28 
 
 		 300 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  78.33 
 
 		 300 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  75.87 
 
 		 300 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  75.09 
 
 		 300 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  55.82 
 
 		 296 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  54.67 
 
 		 395 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  54.67 
 
 		 414 aa  309  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  54.67 
 
 		 296 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  54.67 
 
 		 296 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  56.4 
 
 		 298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  54.33 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  56.4 
 
 		 298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  54.33 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  54.33 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  54.33 
 
 		 316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  56.75 
 
 		 308 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  53.68 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.72 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  55.71 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  56.4 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  56.4 
 
 		 296 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  56.4 
 
 		 296 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.35 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.27 
 
 		 299 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.6 
 
 		 299 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.56 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.86 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  49.83 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  51.39 
 
 		 301 aa  265  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.5 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.83 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  43.9 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  45.94 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  43.15 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  43.15 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.06 
 
 		 303 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  42.81 
 
 		 303 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  44.76 
 
 		 309 aa  221  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  44.6 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  38.19 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  41.1 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  38.41 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.72 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  42.02 
 
 		 284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  38.83 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  32.52 
 
 		 300 aa  152  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  31.53 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  30.47 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  31.71 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  26.69 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  25.59 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  25.89 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  27.89 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  24.91 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  28.35 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  25.86 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  26.05 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.35 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0216  hypothetical protein  31.35 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.030228  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.85 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  26.99 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  29.17 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.48 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  23.85 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.42 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.68 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  25.45 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  27.59 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  23.24 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  29.5 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  25.96 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  24.55 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  24.75 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  26.25 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  24.32 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  26.85 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1972  hypothetical protein  22.3 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  29.52 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  26.23 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  23.13 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1859  integral membrane protein  22.3 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  25.61 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  25.1 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>