152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0535 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  590  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 295 aa  258  9e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.45 
 
 		 292 aa  254  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.45 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.02 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  45.18 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  47.08 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  47.39 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  43.2 
 
 		 298 aa  224  9e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  47.9 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.26 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  46.82 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  47.55 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  46.49 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  46.39 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  46.49 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  39.93 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  39.93 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  46.15 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  46.15 
 
 		 296 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  46.15 
 
 		 296 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  46.15 
 
 		 296 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  47.55 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  47.55 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  43.9 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.6 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  39.6 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.55 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  45.99 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  46.82 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  44.6 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  46.85 
 
 		 300 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  46.55 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  47.92 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  47.9 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  47.9 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  41.05 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  47.55 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  43.75 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  38.57 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  45.99 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  42.21 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  41.95 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.32 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.34 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  36.7 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  38.16 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  36.84 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  36.46 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  41.38 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  34.48 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  34.83 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  32.4 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  26.98 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  28.26 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  28.09 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  25 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  25.94 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  27.61 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  25.75 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  26.94 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  27.21 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.73 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  26.94 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.42 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  30.54 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  25.09 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  24.92 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  27.76 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  28.2 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  29.03 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  22.67 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  27.87 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.24 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.4 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  25.95 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  25.95 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  25.95 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  25.95 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  26.92 
 
 		 321 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 321 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  26.92 
 
 		 321 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  24.4 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2864  hypothetical protein  31.02 
 
 		 319 aa  49.3  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  27.98 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  26.92 
 
 		 321 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  26.92 
 
 		 321 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  26.92 
 
 		 321 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  26.92 
 
 		 321 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  22.97 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  24.11 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>