176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4261 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  589  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  60.2 
 
 		 300 aa  349  4e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  41.32 
 
 		 307 aa  208  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  37.58 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  37.02 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  35.37 
 
 		 395 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  35.37 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  35.37 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  35.03 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  35.03 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  35.03 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  35.03 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  36.46 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  35.09 
 
 		 414 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  38.83 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  36.49 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  36.49 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  34.98 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.4 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  35.15 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  35.23 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.96 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  37.08 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  36.7 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.77 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  36.7 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  36.7 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  35.84 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.34 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  34.38 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  37.5 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  33.45 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  34.8 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  35.47 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  36.21 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  35.64 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  32.51 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.95 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  32.08 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  35.64 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 		 303 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  29.37 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  29.51 
 
 		 303 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  34.97 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.07 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  29.17 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  34.75 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  30.15 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.34 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  26.79 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  28.97 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  34.62 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  26.04 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.67 
 
 		 348 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 		 367 aa  85.5  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.07 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  25.93 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  27.84 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  24.81 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  27.61 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.85 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  28.03 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  26.36 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  25.58 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.47 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.85 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.57 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.85 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  24.46 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  26.39 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  24.73 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  26.03 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  26.26 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  23.55 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  24.55 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  25.09 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  23.55 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  24.55 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  28.04 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.73 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  24.91 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  23.94 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  25.75 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  25.63 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1972  hypothetical protein  23.02 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>