More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA2045 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  99.66 
 
 
296 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  99.66 
 
 
395 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  98.99 
 
 
296 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  94.93 
 
 
414 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  87.5 
 
 
298 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  87.5 
 
 
298 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  87.84 
 
 
296 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  87.16 
 
 
296 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  87.84 
 
 
296 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  87.84 
 
 
296 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  86.82 
 
 
296 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  78.23 
 
 
299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  78.91 
 
 
299 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  54.33 
 
 
300 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  53.95 
 
 
300 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  54.33 
 
 
301 aa  285  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  54.39 
 
 
300 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  54.3 
 
 
298 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  53.98 
 
 
300 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  53.26 
 
 
300 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  56.14 
 
 
300 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  56.84 
 
 
300 aa  265  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  52.1 
 
 
308 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  56.14 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.3 
 
 
300 aa  244  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.78 
 
 
298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.9 
 
 
298 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.42 
 
 
300 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.47 
 
 
292 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  44.07 
 
 
298 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.3 
 
 
299 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  45.1 
 
 
301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  46.15 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.58 
 
 
303 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  42.01 
 
 
309 aa  206  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  42.41 
 
 
303 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  42.41 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.07 
 
 
303 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  42.07 
 
 
303 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  43.16 
 
 
307 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  38.52 
 
 
309 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  42.55 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  39.35 
 
 
293 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  38.75 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  35.49 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.64 
 
 
295 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  44.44 
 
 
284 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  35.03 
 
 
298 aa  162  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  37.93 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  35.11 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  26.17 
 
 
301 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  27.63 
 
 
317 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  27.78 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  29.5 
 
 
321 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  30.77 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 
317 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  27.53 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  26.16 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  30 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  26.06 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  29.64 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  31.36 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  31.99 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  23.99 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  24.83 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 
304 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  24.32 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  24.66 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  23.81 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  30.38 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  25.18 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  30.31 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  24.15 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.67 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  24.32 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  24.32 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  30.92 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  30.92 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  30.92 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  27.46 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  30.92 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  30.86 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  26.03 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  21.94 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  31.5 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  21.94 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0728  hypothetical protein  24.64 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.59 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  24.71 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>