252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6512 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 292 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.76 
 
 		 300 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.85 
 
 		 300 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  52.45 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  53.52 
 
 		 300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  52.28 
 
 		 301 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  52.5 
 
 		 300 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  51.01 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  51.01 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  51.01 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  50.87 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  48.96 
 
 		 301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  49.82 
 
 		 296 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  49.82 
 
 		 296 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  53.17 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  49.82 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  52.3 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  50.18 
 
 		 414 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  49.47 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  49.47 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  49.47 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  49.47 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  51.43 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  53.21 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.93 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  50.18 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  51.23 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  52.14 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  52.14 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  52.14 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  44.25 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  52.14 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  51.07 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.52 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.33 
 
 		 298 aa  225  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.29 
 
 		 299 aa  221  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.1 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  40.62 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  40.62 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  51.79 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  40.28 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.1 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  43.36 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  39.01 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  42.05 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  40.28 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  42.55 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  39.44 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  43.33 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  33.46 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  31.07 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  31.16 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  31.78 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  30.47 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  31.44 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  28.21 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  26.37 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  30.23 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  31.72 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  27.34 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  25.71 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  30.97 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  30.5 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  27.17 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  31.07 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  31.07 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  25.2 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  31.07 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  27.17 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  31.07 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  27.17 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  24.48 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  24.48 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  24.48 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  30.71 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  24.83 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  24.31 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  24.48 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0398  EamA family protein  28.12 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0389  DMT family permease  28.12 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  27.86 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0411  eama family protein  28.12 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0476  transporter, EamA family  28.22 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  26.94 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0456  transporter, EamA family  28.12 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  23.45 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0315  hypothetical protein  30.45 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  28.77 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>