131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0315 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0315  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  565  1e-160  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0670  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.72 
 
 		 274 aa  248  1e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.407071  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  28.83 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  29.69 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  29.06 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  33.16 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  26.21 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  25.09 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.09 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  25.76 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  23.96 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  25.09 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1548  integral membrane protein  27.23 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1657  hypothetical protein  27.23 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  24.73 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  24.73 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  24.73 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  24.73 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  23.13 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  21.99 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.03 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1521  hypothetical protein  23.81 
 
 		 266 aa  57  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.851073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  24.38 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.15 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  22.1 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  26.77 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4813  exported membrane protein  28.25 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000948191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4663  exported membrane protein  28.25 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00303431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4673  exported membrane protein  28.25 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000162371  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4791  hypothetical protein  28.25 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00231071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  29.17 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  25.29 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0386  DMT family permease  23.53 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00214072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0398  EamA family protein  22.96 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0411  eama family protein  22.96 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  21.79 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  22.42 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4755  exported membrane protein  27.8 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000669886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0476  transporter, EamA family  23.7 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  30.08 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0525  EamA family protein  22.39 
 
 		 316 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  25.57 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0389  DMT family permease  23.44 
 
 		 316 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0456  transporter, EamA family  23.44 
 
 		 316 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  27.11 
 
 		 274 aa  52.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.97 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4847  transporter, EamA family  22.76 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.32 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.37 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  26.57 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  26.67 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.03 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  26.67 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  26.67 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  26.67 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  26.67 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.45 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1980  hypothetical protein  26.32 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.463491  normal  0.74257 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  24.86 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  26.32 
 
 		 301 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  23.47 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  22.94 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  28.22 
 
 		 331 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  29.07 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3828  hypothetical protein  25.48 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0332  hypothetical protein  26.14 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  24.89 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0350  hypothetical protein  26.14 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  26.51 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  25.73 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.35 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  26.62 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.31 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  25.98 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  28.16 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  30.46 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.37 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1245  putative permease  25.31 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  35.64 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  25.45 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  23.21 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0897  hypothetical protein  24.37 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.631213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  24.36 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  24.09 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  23.38 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  24.76 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  28.69 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>