More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2498 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  100 
 
 		 306 aa  597  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  63 
 
 		 303 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  64.88 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  47.24 
 
 		 314 aa  252  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  45.48 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  45.7 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1859  integral membrane protein  47.75 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1972  hypothetical protein  47.75 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  35.42 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  27.87 
 
 		 395 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  27.87 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  28.52 
 
 		 414 aa  89.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  27.87 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  27.72 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  27.72 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  27.53 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  27.53 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  27.53 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  27.53 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  27.24 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  27.68 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  26.94 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  28.23 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  27.87 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  27.87 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  27.87 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  29.2 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  27.21 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  27.57 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1533  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  26.74 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  29.52 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  26.99 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  26.16 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.73 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.58 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  23.75 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  26.89 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  25.58 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.89 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.71 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  28.33 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  24.83 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  26.01 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0216  hypothetical protein  26.81 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.030228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  24.5 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  27.24 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  25.75 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  24.22 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  27.05 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  27.05 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  27.05 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  27.3 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.3 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  28.22 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  24.75 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  26.84 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  24.81 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  28.19 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  24.75 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.5 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  24.16 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  25.86 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  24.71 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  25.9 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  28.02 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  24.38 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  26.33 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  29.33 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  23.49 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  27.2 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.4 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  25.9 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  30.52 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  28.83 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  24.73 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  27.54 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  27.86 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.14 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.47 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  23.1 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  24.73 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3775  hypothetical protein  26.82 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  22.83 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  26.94 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  24.54 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>