More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0694 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  607  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  70.13 
 
 		 324 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3775  hypothetical protein  70.07 
 
 		 311 aa  394  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  55.25 
 
 		 298 aa  331  9e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  42.12 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0728  hypothetical protein  38.57 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  36.64 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  35.74 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  34.11 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2967  hypothetical protein  36.9 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105288  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  26.16 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  26.16 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  26.16 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  26.16 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  26.16 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  26.16 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  26.16 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  25.45 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.25 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  26.16 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  24.73 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  24.73 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  27.24 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  26.69 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  23.31 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  28.83 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  27.44 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  26.33 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  23.68 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  23.68 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  23.68 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.3 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.04 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  26.67 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  27.5 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  24.88 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  23.83 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  23.15 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  24.91 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  25.9 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  28.93 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.3 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  23.53 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  26.01 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  26.01 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  26.01 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  26.01 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  26.01 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  26.01 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  23.4 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  27.31 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  26.02 
 
 		 311 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  25 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  23.08 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  25.88 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.5 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  22.76 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.42 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  24.11 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  28.75 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  26.42 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  27.96 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  26.78 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.61 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  28.75 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  25.42 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  28.77 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  23.72 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.49 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.04 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  24.74 
 
 		 314 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  27.24 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  27.09 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  26.04 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  26.04 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  27.24 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  22 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  26.04 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  25.89 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.66 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  26.04 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1859  integral membrane protein  25.56 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>