147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0728 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0728  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  607  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  38.57 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  36.04 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  36.4 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3775  hypothetical protein  39.5 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  36.75 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  36 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  36.02 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105288  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  30.2 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  24.55 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  25.45 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  25.09 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  24.64 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  24.64 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  24.64 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  24.64 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  24.73 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  24.64 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  25.63 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  25.63 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.39 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  25.1 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  27.2 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  25.19 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  25.19 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  25.19 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  24.91 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  24.18 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  27.54 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  26.92 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.64 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  22.42 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  26.07 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.47 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  27.84 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.68 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  25.3 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  25.3 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  24.51 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  21.92 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  24.51 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  21.92 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.52 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  22.04 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  24.66 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  33.52 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  25.59 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5346  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.53 
 
 		 335 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  26.82 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  25.89 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.2 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  23.81 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  23.69 
 
 		 315 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27 
 
 		 301 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  27 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2516  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19993  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3598  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  23.85 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  21.97 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  23.61 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.5 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  23.91 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  22.77 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.57 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  26.5 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  39.19 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  26.5 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  26.5 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  26.5 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  26.5 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 367 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  27.27 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  22.87 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  24.75 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  24.32 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  21.97 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  25.25 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  26.11 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  21.68 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  24.01 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  25.94 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  23.79 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  22.1 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.75 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  21.58 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  23.11 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  22.47 
 
 		 291 aa  47  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  24.29 
 
 		 335 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  26.5 
 
 		 301 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  24.19 
 
 		 310 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>