More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2495 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  656    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  68.62 
 
 
356 aa  391  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.64 
 
 
349 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  60.38 
 
 
364 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5346  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.74 
 
 
335 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3598  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.2 
 
 
340 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2516  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.2 
 
 
340 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19993  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  51.31 
 
 
300 aa  260  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  48.04 
 
 
322 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  46.08 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  46.43 
 
 
313 aa  231  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  45.45 
 
 
316 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  45.45 
 
 
316 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13801  SMR family transporter PecM  43.55 
 
 
313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13721  SMR family transporter  43.73 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.125485  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13511  SMR family transporter  42.81 
 
 
313 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.468275  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1280  SMR family transporter PecM  43.42 
 
 
313 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06161  SMR family transporter  43.18 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  24.65 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  29.96 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  28.53 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  25.44 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  28.66 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  28.66 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  28.42 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  26.54 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.99 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  30.31 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  27.27 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.66 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  28.28 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  26.69 
 
 
312 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  28.86 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  26.44 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.7 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  28.52 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.03 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  27.57 
 
 
279 aa  67  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  26.2 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  25.69 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.74 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  25.9 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  25 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  25.94 
 
 
287 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  25.77 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  25.17 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  24.5 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  25.47 
 
 
313 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  25.17 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.77 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  25.17 
 
 
289 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  26.53 
 
 
303 aa  62.4  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  22.38 
 
 
287 aa  62.4  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  25.96 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.03 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  24.83 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.54 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  23.64 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  24.22 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.54 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  27.66 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  26.5 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.71 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  24.22 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  26.67 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  27.21 
 
 
272 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  23.75 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 
291 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  26.5 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  26.5 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  26.5 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.23 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  26.5 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  24.75 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.06 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.69 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 
299 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 
348 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  26.12 
 
 
293 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.34 
 
 
283 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  23.94 
 
 
298 aa  59.3  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  26.49 
 
 
283 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  25.5 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  24.84 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  25.08 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  27.84 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.14 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  24.75 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>