More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2340 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  584  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.1 
 
 
306 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  70.43 
 
 
306 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.82 
 
 
295 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  48.12 
 
 
297 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.15 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.59 
 
 
293 aa  242  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  47.48 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  47.31 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  47.31 
 
 
292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  47.83 
 
 
321 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  48.49 
 
 
308 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  46.38 
 
 
343 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  44.86 
 
 
298 aa  228  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  48.19 
 
 
294 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  48.19 
 
 
294 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  48.19 
 
 
294 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  46.74 
 
 
293 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  48.19 
 
 
294 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  48.19 
 
 
294 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  48.19 
 
 
294 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  48.19 
 
 
294 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  46.69 
 
 
326 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  46.69 
 
 
294 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  46.76 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  46.34 
 
 
294 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  47.69 
 
 
300 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  44.93 
 
 
293 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  45.29 
 
 
322 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  43.24 
 
 
299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  48.56 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  45.99 
 
 
295 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  43.38 
 
 
303 aa  205  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.64 
 
 
299 aa  205  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  41.3 
 
 
299 aa  203  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  41.3 
 
 
299 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  41.55 
 
 
299 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  41.3 
 
 
299 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  41.3 
 
 
299 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  41.3 
 
 
299 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  41.3 
 
 
299 aa  202  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  46.23 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  43.84 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  43.84 
 
 
300 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  43.84 
 
 
300 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  43.84 
 
 
299 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  43.84 
 
 
299 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  40.07 
 
 
311 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.81 
 
 
300 aa  185  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  43.12 
 
 
298 aa  176  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  34.63 
 
 
296 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  34.28 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  40.36 
 
 
305 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.16 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  39.79 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  34.98 
 
 
304 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  40.45 
 
 
365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.13 
 
 
324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  38.01 
 
 
298 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  36.14 
 
 
298 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.85 
 
 
324 aa  159  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.65 
 
 
306 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  40.34 
 
 
314 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  40.08 
 
 
311 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  39.44 
 
 
300 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  38.04 
 
 
316 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  34.88 
 
 
307 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.85 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  35.87 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  34.56 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  37.68 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  34.88 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  33.9 
 
 
293 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  33.1 
 
 
294 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 
324 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  34.23 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  34.57 
 
 
273 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.2 
 
 
300 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  29.55 
 
 
312 aa  122  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  39.93 
 
 
297 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  35.07 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  32.97 
 
 
303 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  27.72 
 
 
318 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  40.43 
 
 
297 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  30.64 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.42 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  27.4 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  30.74 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  30.9 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  30.9 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  27.33 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  27.7 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  30.21 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  28.82 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.68 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  23.64 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  31.25 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.58 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>