More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06161 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_06161  SMR family transporter  100 
 
 		 319 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  69.74 
 
 		 316 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  69.74 
 
 		 316 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  64.86 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13721  SMR family transporter  60.06 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.125485  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13801  SMR family transporter PecM  59.74 
 
 		 313 aa  362  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13511  SMR family transporter  60.06 
 
 		 313 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.468275  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1280  SMR family transporter PecM  59.42 
 
 		 313 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  65.91 
 
 		 322 aa  355  5.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  65.69 
 
 		 313 aa  351  1e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.48 
 
 		 349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  45.95 
 
 		 364 aa  232  5e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  43.05 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2516  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.51 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19993  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3598  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.51 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5346  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.88 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  46.51 
 
 		 356 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  41.58 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  28.77 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  29.55 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  27.11 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  31.9 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  28.18 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  28.18 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.49 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  24.19 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  26.82 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  27.81 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  27.35 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  27.48 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  25.75 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  23.3 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  27.43 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.84 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  25.27 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  28.19 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  30.03 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  23.41 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.47 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  30.27 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  24 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.82 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.22 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.82 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  29.41 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.47 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.09 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.09 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.45 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  27.68 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  23.23 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.92 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  27.89 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2802  hypothetical protein  27.04 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  25.37 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  23.61 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.75 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  28.67 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  30.72 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.66 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.23 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.36 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  27.05 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  27.05 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  27.05 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.83 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  27.05 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  25.62 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  27.05 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  25.45 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  27.05 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  27.05 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.6 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  28.3 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  25.61 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  25.85 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  26.92 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  22.15 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  27.42 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  29.44 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  26.93 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  22.7 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  28.12 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  25.33 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  25.33 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  25.37 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>