More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3090 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  93.11 
 
 		 305 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  60.41 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  59.46 
 
 		 297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  50 
 
 		 322 aa  308  9e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  42.19 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4181  hypothetical protein  46.64 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4552  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.64 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.05 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  43.84 
 
 		 312 aa  205  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.77 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4694  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.44 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.119165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  36.08 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  34.97 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  35.71 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  35.49 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  36.36 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  36.39 
 
 		 293 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  37.18 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.01 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.92 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  36.79 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  33.22 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  34.38 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  33.11 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  31.36 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.28 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  31.01 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  36.11 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  30.99 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  30.64 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  31.29 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  31.99 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  29.83 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  30.92 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  32.09 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  32.09 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  29.93 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.19 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  31.25 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  31.94 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  31.25 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  30.67 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  31.25 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  34.36 
 
 		 310 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.06 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  33.8 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  28.17 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  28.52 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1426  hypothetical protein  34.1 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  32.29 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  30.14 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  29.97 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  28.48 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  31.62 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  31.74 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  30.61 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  28.11 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  31.56 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  28.42 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  29.02 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.07 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  30.28 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.67 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  27.92 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  28.67 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1370  hypothetical protein  31.49 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.86 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  28.52 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  28.87 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  28.52 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  28.32 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  27.56 
 
 		 303 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0924  hypothetical protein  29.25 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  30.26 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1227  hypothetical protein  30.23 
 
 		 317 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  30.2 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  31.58 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  28.83 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  27.97 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  28.32 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  28.17 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6774  hypothetical protein  31.16 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  26.53 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  29.07 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  28.23 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  27.4 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  27.21 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3381  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.27 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  27.89 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  27.21 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>