275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1780 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  100 
 
 		 322 aa  611  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  77.38 
 
 		 313 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  61.97 
 
 		 316 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  61.97 
 
 		 316 aa  338  8e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06161  SMR family transporter  65.91 
 
 		 319 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13511  SMR family transporter  57.7 
 
 		 313 aa  325  9e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.468275  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13721  SMR family transporter  57.7 
 
 		 313 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.125485  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  58.31 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1280  SMR family transporter PecM  56.72 
 
 		 313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13801  SMR family transporter PecM  57.05 
 
 		 313 aa  318  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.67 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  46.67 
 
 		 364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  48 
 
 		 336 aa  225  8e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5346  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.87 
 
 		 335 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3598  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.9 
 
 		 340 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  50.17 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2516  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.9 
 
 		 340 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19993  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  43.89 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  30.19 
 
 		 324 aa  94.4  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  28.32 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  23.13 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  30.18 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  28.67 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  27.18 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.6 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  30.93 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  30.04 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  30.04 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  29.02 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  27.99 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  26.17 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  30.57 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  27.36 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  26.06 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.73 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  28.09 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  22.9 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  27.15 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  25.35 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  27.95 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  29.35 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  25.6 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.37 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  28.48 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  29.27 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  22.12 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  28.33 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  34.97 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.89 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  25.49 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  28.96 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  28.62 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  23.13 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  25.59 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  23.13 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  25.7 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  25.49 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  29 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.09 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  24.09 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  24.09 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  24.09 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.92 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  24.09 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  31.68 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  28.47 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  22.79 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  23.83 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.79 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  27.86 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  23.83 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  23.83 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  23.69 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  22.79 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  23.83 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  22.79 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  22.79 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  23.15 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  22.79 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  23.36 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  22.06 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  25.75 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  21.84 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.06 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  23.78 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  22.6 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  22.06 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>