More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1917 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  100 
 
 		 364 aa  693    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.62 
 
 		 349 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  62.57 
 
 		 356 aa  342  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  60.06 
 
 		 336 aa  341  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3598  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.63 
 
 		 340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2516  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.32 
 
 		 340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19993  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5346  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.3 
 
 		 335 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  43.95 
 
 		 316 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  43.88 
 
 		 316 aa  242  9e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  47.6 
 
 		 300 aa  227  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  44.69 
 
 		 317 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  46.67 
 
 		 322 aa  226  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13801  SMR family transporter PecM  43.64 
 
 		 313 aa  222  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13721  SMR family transporter  42.51 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.125485  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1280  SMR family transporter PecM  42.6 
 
 		 313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  45.12 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13511  SMR family transporter  43.12 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.468275  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06161  SMR family transporter  45.83 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  29.01 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  28.7 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  27.99 
 
 		 296 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  30.63 
 
 		 324 aa  86.7  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.83 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  25.52 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  24.03 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  25.24 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  27 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.49 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  26.28 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  26.51 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  26.79 
 
 		 304 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  26.52 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  27.5 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  27.11 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  26.15 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.05 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.4 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  27.41 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  27.94 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  27.94 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  28.03 
 
 		 301 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  28.03 
 
 		 301 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  27.54 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  28.22 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  27.99 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  25.15 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  26.6 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.59 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.29 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  27.04 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  27.67 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  27.67 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  23.64 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  25.62 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  25.62 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  25.62 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  25.59 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  23.72 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  26.25 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  26.25 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  27.02 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.29 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  24.62 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  25.31 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  24.47 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  23.57 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.68 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  26.62 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.48 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  25.08 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  25.24 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.71 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  25.24 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  22.7 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  27.5 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  26.65 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.55 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  23.76 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  25.96 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  21.13 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  27.45 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  37.1 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  24.7 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  25.16 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  28.57 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  29.37 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  29.08 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  34.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  24.91 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  27.78 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>