More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4940 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  565  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.88 
 
 		 314 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.66 
 
 		 301 aa  255  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  48.11 
 
 		 293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  44.63 
 
 		 324 aa  248  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  46.33 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  49.81 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  46.33 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  49.82 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.36 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  53.36 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  46.43 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  44.78 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  49.62 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  45.07 
 
 		 290 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  51.92 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.64 
 
 		 290 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.1 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.12 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.43 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  50.94 
 
 		 395 aa  205  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  43.22 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  42.81 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  41.76 
 
 		 335 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.97 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  48.81 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  41.83 
 
 		 272 aa  172  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.64 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.7 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  36.26 
 
 		 285 aa  133  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  36.54 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  36.54 
 
 		 285 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.77 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  35.77 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.41 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  37.45 
 
 		 284 aa  122  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  37.45 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  37.45 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  36.68 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  31.97 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  31.23 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  31.76 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  31.12 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  28.32 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 		 367 aa  79  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  29.49 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.89 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.57 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.71 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.29 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.05 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  27.33 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.04 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  30.19 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.03 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  25.72 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25.09 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  27.09 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  33.91 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  29.93 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  43.18 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  29.22 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  26.85 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  26.85 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  31.18 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.47 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  27.18 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  31.25 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  26.74 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  26.64 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  24.69 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  29.96 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.49 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.97 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  26.71 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  31.47 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  26.74 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  31.47 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  27.7 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  28.52 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  27.63 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  25.66 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.88 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0728  hypothetical protein  26.92 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  29.43 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.02 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  25.61 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.48 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>