247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5303 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 307 aa  597  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  74.91 
 
 		 316 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  45.68 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  42.05 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.01 
 
 		 306 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  41.11 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  37.08 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  34.8 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.79 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  35.45 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  33.01 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  33.09 
 
 		 343 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  33.8 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  34.38 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  34.38 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.89 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  32.28 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  32.76 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  33.09 
 
 		 512 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  26.85 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  31.58 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.92 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.92 
 
 		 312 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  31.65 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  32.27 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  32.31 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  31.68 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  31.68 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  31.68 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  30.1 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  27.15 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  27.15 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  34.06 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  26.53 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.86 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  25.5 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  34.72 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  27.34 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  27.34 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  33.46 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.12 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  27.54 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  28.03 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  34.32 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.88 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  32.84 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  34.39 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  34.34 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  29.43 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  25.99 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.32 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  34.23 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.08 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  25.42 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  30.36 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  30.23 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  30.23 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  27.78 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.87 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  28.01 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  28.42 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  24.91 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.76 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  25.38 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.11 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  27.78 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  24.62 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  23.57 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.1 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  22.58 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  22.26 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  23.86 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  31.49 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  33.2 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  25.81 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  22.78 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.02 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  24.07 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  29.56 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  29.56 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  29.56 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.95 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  28.83 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  29.41 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  24.17 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  27.83 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4761  hypothetical protein  36.23 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  29.05 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  26.51 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>